Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8R3C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8R3C1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8R3C1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8R3C1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Q8R3C1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8R3C1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q8R3C1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8R3C1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q8R3C1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8R3C1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8R3C1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8R3C1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8R3C1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8R3C1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8R3C1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8R3C1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8R3C1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8R3C1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8R3C1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8R3C1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8R3C1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8R3C1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8R3C1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8R3C1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q8R3C1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q8R3C1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q8R3C1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q8R3C1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8R3C1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q8R3C1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q8R3C1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q8R3C1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8R3C1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8R3C1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q8R3C1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q8R3C1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms