Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf13Q8K2W6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf13Q8K2W6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf13Q8K2W6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf13Q8K2W6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Phf13Q8K2W6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf13Q8K2W6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf13Q8K2W6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf13Q8K2W6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf13Q8K2W6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf13Q8K2W6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf13Q8K2W6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms