Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Paf1Q8K2T8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Paf1Q8K2T8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Paf1Q8K2T8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Paf1Q8K2T8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Paf1Q8K2T8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Paf1Q8K2T8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Paf1Q8K2T8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Paf1Q8K2T8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Paf1Q8K2T8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Paf1Q8K2T8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Paf1Q8K2T8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Paf1Q8K2T8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Paf1Q8K2T8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Paf1Q8K2T8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Paf1Q8K2T8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Paf1Q8K2T8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Paf1Q8K2T8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Paf1Q8K2T8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Paf1Q8K2T8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Paf1Q8K2T8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Paf1Q8K2T8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Paf1Q8K2T8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Paf1Q8K2T8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Paf1Q8K2T8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Paf1Q8K2T8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Paf1Q8K2T8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Paf1Q8K2T8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Paf1Q8K2T8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Paf1Q8K2T8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Paf1Q8K2T8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Paf1Q8K2T8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Paf1Q8K2T8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Paf1Q8K2T8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Paf1Q8K2T8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Paf1Q8K2T8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms