Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1N2

Phldb2, Pleckstrin homology-like domain family B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb2Q8K1N2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Phldb2Q8K1N2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Phldb2Q8K1N2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Phldb2Q8K1N2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Phldb2Q8K1N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Phldb2Q8K1N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Phldb2Q8K1N2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Phldb2Q8K1N2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phldb2Q8K1N2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phldb2Q8K1N2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phldb2Q8K1N2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Phldb2Q8K1N2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Phldb2Q8K1N2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phldb2Q8K1N2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phldb2Q8K1N2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Phldb2Q8K1N2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms