Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lmbrd1Q8K0B2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lmbrd1Q8K0B2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbrd1Q8K0B2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lmbrd1Q8K0B2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lmbrd1Q8K0B2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmbrd1Q8K0B2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmbrd1Q8K0B2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmbrd1Q8K0B2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmbrd1Q8K0B2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmbrd1Q8K0B2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmbrd1Q8K0B2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmbrd1Q8K0B2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lmbrd1Q8K0B2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lmbrd1Q8K0B2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmbrd1Q8K0B2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmbrd1Q8K0B2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Lmbrd1Q8K0B2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmbrd1Q8K0B2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms