Protein–RNA interactions for Protein: Q8K057

Ift80, Intraflagellar transport protein 80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift80Q8K057 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift80Q8K057 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ift80Q8K057 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift80Q8K057 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ift80Q8K057 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ift80Q8K057 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ift80Q8K057 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ift80Q8K057 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift80Q8K057 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift80Q8K057 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ift80Q8K057 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ift80Q8K057 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms