Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mterf1aQ8CHZ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mterf1aQ8CHZ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mterf1aQ8CHZ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mterf1aQ8CHZ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mterf1aQ8CHZ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mterf1aQ8CHZ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mterf1aQ8CHZ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mterf1aQ8CHZ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mterf1aQ8CHZ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mterf1aQ8CHZ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mterf1aQ8CHZ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mterf1aQ8CHZ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mterf1aQ8CHZ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mterf1aQ8CHZ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mterf1aQ8CHZ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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