Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc43a2Q8CGA3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc43a2Q8CGA3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc43a2Q8CGA3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Slc43a2Q8CGA3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc43a2Q8CGA3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc43a2Q8CGA3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc43a2Q8CGA3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc43a2Q8CGA3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc43a2Q8CGA3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc43a2Q8CGA3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc43a2Q8CGA3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms