Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA2

Amt, Aminomethyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmtQ8CFA2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AmtQ8CFA2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmtQ8CFA2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AmtQ8CFA2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AmtQ8CFA2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AmtQ8CFA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmtQ8CFA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmtQ8CFA2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AmtQ8CFA2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AmtQ8CFA2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AmtQ8CFA2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AmtQ8CFA2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AmtQ8CFA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AmtQ8CFA2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
AmtQ8CFA2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms