Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Usp27Q8CEG8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp27Q8CEG8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Usp27Q8CEG8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp27Q8CEG8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp27Q8CEG8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp27Q8CEG8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp27Q8CEG8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp27Q8CEG8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp27Q8CEG8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp27Q8CEG8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp27Q8CEG8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Usp27Q8CEG8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Usp27Q8CEG8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Usp27Q8CEG8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp27Q8CEG8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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