Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Lrrc9Q8CDN9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Lrrc9Q8CDN9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Lrrc9Q8CDN9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Lrrc9Q8CDN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Lrrc9Q8CDN9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Lrrc9Q8CDN9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Lrrc9Q8CDN9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Lrrc9Q8CDN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
Lrrc9Q8CDN9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Lrrc9Q8CDN9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Lrrc9Q8CDN9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Lrrc9Q8CDN9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Lrrc9Q8CDN9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Lrrc9Q8CDN9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Lrrc9Q8CDN9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Lrrc9Q8CDN9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Lrrc9Q8CDN9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Lrrc9Q8CDN9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrrc9Q8CDN9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Lrrc9Q8CDN9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Lrrc9Q8CDN9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Lrrc9Q8CDN9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Lrrc9Q8CDN9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
Lrrc9Q8CDN9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Lrrc9Q8CDN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Lrrc9Q8CDN9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Lrrc9Q8CDN9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Lrrc9Q8CDN9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Lrrc9Q8CDN9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
Lrrc9Q8CDN9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Lrrc9Q8CDN9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Lrrc9Q8CDN9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39.58■■■■□ 3.93
Lrrc9Q8CDN9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Lrrc9Q8CDN9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Lrrc9Q8CDN9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Lrrc9Q8CDN9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Lrrc9Q8CDN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Lrrc9Q8CDN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Lrrc9Q8CDN9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Lrrc9Q8CDN9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Lrrc9Q8CDN9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Lrrc9Q8CDN9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Lrrc9Q8CDN9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Lrrc9Q8CDN9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Lrrc9Q8CDN9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Lrrc9Q8CDN9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lrrc9Q8CDN9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lrrc9Q8CDN9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lrrc9Q8CDN9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Lrrc9Q8CDN9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
Lrrc9Q8CDN9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Lrrc9Q8CDN9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Lrrc9Q8CDN9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Lrrc9Q8CDN9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Lrrc9Q8CDN9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms