Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc87Q8CDL9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc87Q8CDL9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc87Q8CDL9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc87Q8CDL9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc87Q8CDL9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc87Q8CDL9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc87Q8CDL9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc87Q8CDL9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc87Q8CDL9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms