Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol7cQ8C6E1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol7cQ8C6E1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol7cQ8C6E1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apol7cQ8C6E1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apol7cQ8C6E1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apol7cQ8C6E1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apol7cQ8C6E1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apol7cQ8C6E1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol7cQ8C6E1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apol7cQ8C6E1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apol7cQ8C6E1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apol7cQ8C6E1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apol7cQ8C6E1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apol7cQ8C6E1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apol7cQ8C6E1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apol7cQ8C6E1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol7cQ8C6E1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apol7cQ8C6E1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apol7cQ8C6E1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Apol7cQ8C6E1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Apol7cQ8C6E1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apol7cQ8C6E1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Apol7cQ8C6E1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Apol7cQ8C6E1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apol7cQ8C6E1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Apol7cQ8C6E1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7cQ8C6E1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7cQ8C6E1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7cQ8C6E1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7cQ8C6E1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Apol7cQ8C6E1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms