Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bhlhe22Q8C6A8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bhlhe22Q8C6A8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bhlhe22Q8C6A8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bhlhe22Q8C6A8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bhlhe22Q8C6A8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bhlhe22Q8C6A8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bhlhe22Q8C6A8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Bhlhe22Q8C6A8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bhlhe22Q8C6A8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bhlhe22Q8C6A8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Bhlhe22Q8C6A8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bhlhe22Q8C6A8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bhlhe22Q8C6A8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bhlhe22Q8C6A8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms