Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y2

Gm9999, Predicted gene 9999, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9999Q8C5Y2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm9999Q8C5Y2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9999Q8C5Y2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9999Q8C5Y2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9999Q8C5Y2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm9999Q8C5Y2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9999Q8C5Y2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9999Q8C5Y2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm9999Q8C5Y2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm9999Q8C5Y2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms