Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc44a2Q8BY89 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc44a2Q8BY89 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc44a2Q8BY89 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc44a2Q8BY89 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a2Q8BY89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc44a2Q8BY89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc44a2Q8BY89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc44a2Q8BY89 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc44a2Q8BY89 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc44a2Q8BY89 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a2Q8BY89 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc44a2Q8BY89 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc44a2Q8BY89 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc44a2Q8BY89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc44a2Q8BY89 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc44a2Q8BY89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc44a2Q8BY89 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc44a2Q8BY89 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc44a2Q8BY89 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc44a2Q8BY89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc44a2Q8BY89 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc44a2Q8BY89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc44a2Q8BY89 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc44a2Q8BY89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc44a2Q8BY89 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc44a2Q8BY89 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a2Q8BY89 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a2Q8BY89 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms