Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmem87aQ8BXN9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem87aQ8BXN9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmem87aQ8BXN9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmem87aQ8BXN9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmem87aQ8BXN9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmem87aQ8BXN9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem87aQ8BXN9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmem87aQ8BXN9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmem87aQ8BXN9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmem87aQ8BXN9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmem87aQ8BXN9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tmem87aQ8BXN9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tmem87aQ8BXN9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmem87aQ8BXN9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmem87aQ8BXN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem87aQ8BXN9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms