Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DseQ8BLI4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DseQ8BLI4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DseQ8BLI4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DseQ8BLI4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DseQ8BLI4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DseQ8BLI4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DseQ8BLI4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DseQ8BLI4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DseQ8BLI4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
DseQ8BLI4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DseQ8BLI4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DseQ8BLI4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DseQ8BLI4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DseQ8BLI4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DseQ8BLI4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DseQ8BLI4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DseQ8BLI4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DseQ8BLI4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DseQ8BLI4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DseQ8BLI4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms