Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup93Q8BJ71 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nup93Q8BJ71 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup93Q8BJ71 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nup93Q8BJ71 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nup93Q8BJ71 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nup93Q8BJ71 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup93Q8BJ71 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nup93Q8BJ71 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nup93Q8BJ71 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup93Q8BJ71 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup93Q8BJ71 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nup93Q8BJ71 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nup93Q8BJ71 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nup93Q8BJ71 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nup93Q8BJ71 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nup93Q8BJ71 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup93Q8BJ71 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup93Q8BJ71 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nup93Q8BJ71 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup93Q8BJ71 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nup93Q8BJ71 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup93Q8BJ71 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nup93Q8BJ71 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nup93Q8BJ71 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nup93Q8BJ71 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nup93Q8BJ71 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nup93Q8BJ71 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms