Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG55

Gpr171, Probable G-protein coupled receptor 171, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr171Q8BG55 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpr171Q8BG55 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpr171Q8BG55 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpr171Q8BG55 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpr171Q8BG55 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpr171Q8BG55 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gpr171Q8BG55 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpr171Q8BG55 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpr171Q8BG55 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpr171Q8BG55 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpr171Q8BG55 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpr171Q8BG55 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpr171Q8BG55 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpr171Q8BG55 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpr171Q8BG55 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpr171Q8BG55 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpr171Q8BG55 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpr171Q8BG55 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpr171Q8BG55 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpr171Q8BG55 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpr171Q8BG55 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpr171Q8BG55 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr171Q8BG55 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr171Q8BG55 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr171Q8BG55 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr171Q8BG55 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr171Q8BG55 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr171Q8BG55 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gpr171Q8BG55 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gpr171Q8BG55 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gpr171Q8BG55 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gpr171Q8BG55 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms