Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
H2-M10.6Q85ZW5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
H2-M10.6Q85ZW5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2-M10.6Q85ZW5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
H2-M10.6Q85ZW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-M10.6Q85ZW5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-M10.6Q85ZW5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-M10.6Q85ZW5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
H2-M10.6Q85ZW5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms