Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IfneQ80ZF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IfneQ80ZF2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IfneQ80ZF2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IfneQ80ZF2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IfneQ80ZF2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IfneQ80ZF2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IfneQ80ZF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IfneQ80ZF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IfneQ80ZF2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IfneQ80ZF2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IfneQ80ZF2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IfneQ80ZF2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IfneQ80ZF2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IfneQ80ZF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IfneQ80ZF2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IfneQ80ZF2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IfneQ80ZF2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IfneQ80ZF2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IfneQ80ZF2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IfneQ80ZF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IfneQ80ZF2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IfneQ80ZF2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IfneQ80ZF2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IfneQ80ZF2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IfneQ80ZF2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IfneQ80ZF2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms