Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM3

Cplx4, Complexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx4Q80WM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cplx4Q80WM3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cplx4Q80WM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cplx4Q80WM3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cplx4Q80WM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cplx4Q80WM3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cplx4Q80WM3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cplx4Q80WM3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cplx4Q80WM3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cplx4Q80WM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cplx4Q80WM3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cplx4Q80WM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cplx4Q80WM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cplx4Q80WM3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cplx4Q80WM3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cplx4Q80WM3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cplx4Q80WM3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cplx4Q80WM3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cplx4Q80WM3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cplx4Q80WM3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms