Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pja2Q80U04 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pja2Q80U04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pja2Q80U04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pja2Q80U04 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pja2Q80U04 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pja2Q80U04 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pja2Q80U04 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pja2Q80U04 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pja2Q80U04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pja2Q80U04 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms