Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sgo2Q7TSY8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgo2Q7TSY8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sgo2Q7TSY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgo2Q7TSY8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sgo2Q7TSY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sgo2Q7TSY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sgo2Q7TSY8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sgo2Q7TSY8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sgo2Q7TSY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sgo2Q7TSY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgo2Q7TSY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sgo2Q7TSY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sgo2Q7TSY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgo2Q7TSY8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgo2Q7TSY8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sgo2Q7TSY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sgo2Q7TSY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sgo2Q7TSY8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sgo2Q7TSY8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sgo2Q7TSY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms