Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdh8Q7TSK3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcdh8Q7TSK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcdh8Q7TSK3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdh8Q7TSK3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcdh8Q7TSK3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcdh8Q7TSK3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcdh8Q7TSK3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcdh8Q7TSK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcdh8Q7TSK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh8Q7TSK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdh8Q7TSK3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdh8Q7TSK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh8Q7TSK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh8Q7TSK3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh8Q7TSK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh8Q7TSK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh8Q7TSK3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh8Q7TSK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh8Q7TSK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh8Q7TSK3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh8Q7TSK3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms