Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp397Q7TNK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zfp397Q7TNK4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp397Q7TNK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp397Q7TNK4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp397Q7TNK4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp397Q7TNK4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfp397Q7TNK4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Zfp397Q7TNK4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfp397Q7TNK4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zfp397Q7TNK4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zfp397Q7TNK4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zfp397Q7TNK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zfp397Q7TNK4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zfp397Q7TNK4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Zfp397Q7TNK4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Zfp397Q7TNK4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zfp397Q7TNK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zfp397Q7TNK4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Zfp397Q7TNK4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Zfp397Q7TNK4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfp397Q7TNK4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Zfp397Q7TNK4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zfp397Q7TNK4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zfp397Q7TNK4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfp397Q7TNK4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms