Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf2Q7TMI3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uhrf2Q7TMI3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uhrf2Q7TMI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uhrf2Q7TMI3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uhrf2Q7TMI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf2Q7TMI3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms