Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fam107aQ78TU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fam107aQ78TU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam107aQ78TU8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam107aQ78TU8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam107aQ78TU8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam107aQ78TU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam107aQ78TU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Fam107aQ78TU8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam107aQ78TU8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam107aQ78TU8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fam107aQ78TU8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam107aQ78TU8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fam107aQ78TU8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fam107aQ78TU8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam107aQ78TU8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam107aQ78TU8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam107aQ78TU8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam107aQ78TU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam107aQ78TU8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam107aQ78TU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam107aQ78TU8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam107aQ78TU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms