Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Snd1Q78PY7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Snd1Q78PY7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Snd1Q78PY7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snd1Q78PY7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Snd1Q78PY7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Snd1Q78PY7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snd1Q78PY7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snd1Q78PY7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Snd1Q78PY7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Snd1Q78PY7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Snd1Q78PY7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snd1Q78PY7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Snd1Q78PY7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snd1Q78PY7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Snd1Q78PY7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Snd1Q78PY7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Snd1Q78PY7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Snd1Q78PY7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snd1Q78PY7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Snd1Q78PY7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Snd1Q78PY7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snd1Q78PY7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Snd1Q78PY7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snd1Q78PY7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Snd1Q78PY7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Snd1Q78PY7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms