Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Higd1cQ76I25 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Higd1cQ76I25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Higd1cQ76I25 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Higd1cQ76I25 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Higd1cQ76I25 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Higd1cQ76I25 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Higd1cQ76I25 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Higd1cQ76I25 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Higd1cQ76I25 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms