Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnot1Q6ZQ08 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot1Q6ZQ08 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot1Q6ZQ08 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Cnot1Q6ZQ08 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot1Q6ZQ08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot1Q6ZQ08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot1Q6ZQ08 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot1Q6ZQ08 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot1Q6ZQ08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot1Q6ZQ08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot1Q6ZQ08 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cnot1Q6ZQ08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot1Q6ZQ08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot1Q6ZQ08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot1Q6ZQ08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnot1Q6ZQ08 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot1Q6ZQ08 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot1Q6ZQ08 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot1Q6ZQ08 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot1Q6ZQ08 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot1Q6ZQ08 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot1Q6ZQ08 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot1Q6ZQ08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot1Q6ZQ08 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot1Q6ZQ08 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cnot1Q6ZQ08 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnot1Q6ZQ08 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms