Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp8b3Q6UQ17 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Atp8b3Q6UQ17 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp8b3Q6UQ17 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp8b3Q6UQ17 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Atp8b3Q6UQ17 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Atp8b3Q6UQ17 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Atp8b3Q6UQ17 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Atp8b3Q6UQ17 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Atp8b3Q6UQ17 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Atp8b3Q6UQ17 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Atp8b3Q6UQ17 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atp8b3Q6UQ17 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Atp8b3Q6UQ17 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Atp8b3Q6UQ17 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp8b3Q6UQ17 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Atp8b3Q6UQ17 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp8b3Q6UQ17 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Atp8b3Q6UQ17 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Atp8b3Q6UQ17 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atp8b3Q6UQ17 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atp8b3Q6UQ17 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atp8b3Q6UQ17 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atp8b3Q6UQ17 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atp8b3Q6UQ17 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atp8b3Q6UQ17 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atp8b3Q6UQ17 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms