Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS9

Cacna2d2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d2Q6PHS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cacna2d2Q6PHS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna2d2Q6PHS9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cacna2d2Q6PHS9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cacna2d2Q6PHS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna2d2Q6PHS9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna2d2Q6PHS9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cacna2d2Q6PHS9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna2d2Q6PHS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms