Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a7Q6PGE7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a7Q6PGE7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a7Q6PGE7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc6a7Q6PGE7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a7Q6PGE7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a7Q6PGE7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a7Q6PGE7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a7Q6PGE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms