Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RgmaQ6PCX7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RgmaQ6PCX7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RgmaQ6PCX7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RgmaQ6PCX7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RgmaQ6PCX7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RgmaQ6PCX7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RgmaQ6PCX7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RgmaQ6PCX7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RgmaQ6PCX7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RgmaQ6PCX7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RgmaQ6PCX7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RgmaQ6PCX7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RgmaQ6PCX7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RgmaQ6PCX7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RgmaQ6PCX7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RgmaQ6PCX7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RgmaQ6PCX7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RgmaQ6PCX7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms