Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc117Q6PB51 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc117Q6PB51 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc117Q6PB51 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc117Q6PB51 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc117Q6PB51 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc117Q6PB51 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc117Q6PB51 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc117Q6PB51 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc117Q6PB51 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc117Q6PB51 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc117Q6PB51 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc117Q6PB51 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc117Q6PB51 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc117Q6PB51 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc117Q6PB51 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc117Q6PB51 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc117Q6PB51 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc117Q6PB51 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc117Q6PB51 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc117Q6PB51 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc117Q6PB51 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc117Q6PB51 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc117Q6PB51 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc117Q6PB51 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc117Q6PB51 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms