Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp49Q6P9L4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp49Q6P9L4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp49Q6P9L4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp49Q6P9L4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp49Q6P9L4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp49Q6P9L4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Usp49Q6P9L4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp49Q6P9L4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp49Q6P9L4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Usp49Q6P9L4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Usp49Q6P9L4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Usp49Q6P9L4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Usp49Q6P9L4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Usp49Q6P9L4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp49Q6P9L4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Usp49Q6P9L4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Usp49Q6P9L4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Usp49Q6P9L4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp49Q6P9L4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Usp49Q6P9L4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Usp49Q6P9L4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp49Q6P9L4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp49Q6P9L4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Usp49Q6P9L4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp49Q6P9L4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Usp49Q6P9L4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp49Q6P9L4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Usp49Q6P9L4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp49Q6P9L4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp49Q6P9L4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp49Q6P9L4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp49Q6P9L4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp49Q6P9L4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp49Q6P9L4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp49Q6P9L4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp49Q6P9L4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp49Q6P9L4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp49Q6P9L4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp49Q6P9L4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp49Q6P9L4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp49Q6P9L4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp49Q6P9L4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms