Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcf1Q6P542 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcf1Q6P542 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcf1Q6P542 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcf1Q6P542 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcf1Q6P542 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcf1Q6P542 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcf1Q6P542 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcf1Q6P542 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcf1Q6P542 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcf1Q6P542 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcf1Q6P542 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Abcf1Q6P542 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcf1Q6P542 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcf1Q6P542 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcf1Q6P542 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcf1Q6P542 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Abcf1Q6P542 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcf1Q6P542 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Abcf1Q6P542 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Abcf1Q6P542 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Abcf1Q6P542 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Abcf1Q6P542 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcf1Q6P542 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Abcf1Q6P542 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms