Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snrnp200Q6P4T2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrnp200Q6P4T2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snrnp200Q6P4T2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snrnp200Q6P4T2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snrnp200Q6P4T2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snrnp200Q6P4T2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Snrnp200Q6P4T2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snrnp200Q6P4T2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snrnp200Q6P4T2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrnp200Q6P4T2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrnp200Q6P4T2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrnp200Q6P4T2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrnp200Q6P4T2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp200Q6P4T2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp200Q6P4T2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp200Q6P4T2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp200Q6P4T2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrnp200Q6P4T2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms