Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltbQ6IRU5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltbQ6IRU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CltbQ6IRU5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CltbQ6IRU5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CltbQ6IRU5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltbQ6IRU5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CltbQ6IRU5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CltbQ6IRU5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltbQ6IRU5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CltbQ6IRU5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CltbQ6IRU5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CltbQ6IRU5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltbQ6IRU5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CltbQ6IRU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CltbQ6IRU5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CltbQ6IRU5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CltbQ6IRU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltbQ6IRU5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CltbQ6IRU5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms