Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm5416Q6IE28 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm5416Q6IE28 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm5416Q6IE28 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm5416Q6IE28 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm5416Q6IE28 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm5416Q6IE28 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm5416Q6IE28 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm5416Q6IE28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5416Q6IE28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm5416Q6IE28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5416Q6IE28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms