Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Hecw2Q6I6G8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Hecw2Q6I6G8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Hecw2Q6I6G8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Hecw2Q6I6G8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Hecw2Q6I6G8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Hecw2Q6I6G8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Hecw2Q6I6G8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Hecw2Q6I6G8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Hecw2Q6I6G8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Hecw2Q6I6G8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
Hecw2Q6I6G8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Hecw2Q6I6G8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38.81■■■■□ 3.8
Hecw2Q6I6G8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Hecw2Q6I6G8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Hecw2Q6I6G8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Hecw2Q6I6G8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
Hecw2Q6I6G8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Hecw2Q6I6G8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Hecw2Q6I6G8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Hecw2Q6I6G8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Hecw2Q6I6G8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Hecw2Q6I6G8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Hecw2Q6I6G8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Hecw2Q6I6G8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Hecw2Q6I6G8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Hecw2Q6I6G8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Hecw2Q6I6G8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Hecw2Q6I6G8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Hecw2Q6I6G8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Hecw2Q6I6G8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Hecw2Q6I6G8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Hecw2Q6I6G8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Hecw2Q6I6G8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Hecw2Q6I6G8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Hecw2Q6I6G8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Hecw2Q6I6G8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Hecw2Q6I6G8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Hecw2Q6I6G8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Hecw2Q6I6G8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Hecw2Q6I6G8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Hecw2Q6I6G8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Hecw2Q6I6G8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Hecw2Q6I6G8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Hecw2Q6I6G8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Hecw2Q6I6G8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Hecw2Q6I6G8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Hecw2Q6I6G8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
Hecw2Q6I6G8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Hecw2Q6I6G8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms