Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa17Q64016 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Defa17Q64016 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Defa17Q64016 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Defa17Q64016 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Defa17Q64016 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa17Q64016 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Defa17Q64016 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Defa17Q64016 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Defa17Q64016 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Defa17Q64016 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa17Q64016 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Defa17Q64016 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms