Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AtmQ62388 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AtmQ62388 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AtmQ62388 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AtmQ62388 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AtmQ62388 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
AtmQ62388 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AtmQ62388 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AtmQ62388 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AtmQ62388 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
AtmQ62388 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
AtmQ62388 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AtmQ62388 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AtmQ62388 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AtmQ62388 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AtmQ62388 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AtmQ62388 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AtmQ62388 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AtmQ62388 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AtmQ62388 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AtmQ62388 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AtmQ62388 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtmQ62388 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtmQ62388 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AtmQ62388 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
AtmQ62388 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AtmQ62388 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AtmQ62388 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AtmQ62388 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AtmQ62388 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AtmQ62388 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AtmQ62388 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AtmQ62388 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AtmQ62388 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AtmQ62388 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AtmQ62388 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AtmQ62388 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AtmQ62388 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AtmQ62388 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtmQ62388 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AtmQ62388 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtmQ62388 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AtmQ62388 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms