Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4aQ62178 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema4aQ62178 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema4aQ62178 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sema4aQ62178 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema4aQ62178 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sema4aQ62178 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sema4aQ62178 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sema4aQ62178 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4aQ62178 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sema4aQ62178 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4aQ62178 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema4aQ62178 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4aQ62178 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sema4aQ62178 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema4aQ62178 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema4aQ62178 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sema4aQ62178 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sema4aQ62178 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sema4aQ62178 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema4aQ62178 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sema4aQ62178 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sema4aQ62178 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
Sema4aQ62178 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sema4aQ62178 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms