Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Sema4aQ62178 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Sema4aQ62178 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Sema4aQ62178 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Sema4aQ62178 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sema4aQ62178 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Sema4aQ62178 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Sema4aQ62178 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sema4aQ62178 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sema4aQ62178 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sema4aQ62178 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sema4aQ62178 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sema4aQ62178 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Sema4aQ62178 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sema4aQ62178 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sema4aQ62178 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Sema4aQ62178 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Sema4aQ62178 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sema4aQ62178 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sema4aQ62178 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sema4aQ62178 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Sema4aQ62178 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sema4aQ62178 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sema4aQ62178 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sema4aQ62178 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sema4aQ62178 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sema4aQ62178 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sema4aQ62178 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sema4aQ62178 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Sema4aQ62178 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sema4aQ62178 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Sema4aQ62178 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sema4aQ62178 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sema4aQ62178 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sema4aQ62178 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Sema4aQ62178 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Sema4aQ62178 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Sema4aQ62178 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Sema4aQ62178 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sema4aQ62178 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sema4aQ62178 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sema4aQ62178 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sema4aQ62178 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sema4aQ62178 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sema4aQ62178 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sema4aQ62178 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sema4aQ62178 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sema4aQ62178 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sema4aQ62178 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sema4aQ62178 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Sema4aQ62178 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sema4aQ62178 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sema4aQ62178 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sema4aQ62178 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema4aQ62178 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema4aQ62178 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema4aQ62178 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema4aQ62178 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sema4aQ62178 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sema4aQ62178 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema4aQ62178 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema4aQ62178 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Sema4aQ62178 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sema4aQ62178 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sema4aQ62178 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema4aQ62178 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema4aQ62178 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema4aQ62178 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema4aQ62178 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema4aQ62178 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema4aQ62178 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema4aQ62178 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Sema4aQ62178 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Sema4aQ62178 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Sema4aQ62178 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema4aQ62178 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Sema4aQ62178 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Sema4aQ62178 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sema4aQ62178 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sema4aQ62178 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sema4aQ62178 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sema4aQ62178 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema4aQ62178 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sema4aQ62178 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sema4aQ62178 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Sema4aQ62178 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema4aQ62178 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema4aQ62178 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema4aQ62178 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema4aQ62178 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Sema4aQ62178 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Sema4aQ62178 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sema4aQ62178 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sema4aQ62178 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema4aQ62178 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sema4aQ62178 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sema4aQ62178 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Sema4aQ62178 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sema4aQ62178 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sema4aQ62178 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms