Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phox2aQ62066 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phox2aQ62066 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Phox2aQ62066 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Phox2aQ62066 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phox2aQ62066 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phox2aQ62066 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Phox2aQ62066 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Phox2aQ62066 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phox2aQ62066 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Phox2aQ62066 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phox2aQ62066 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phox2aQ62066 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Phox2aQ62066 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Phox2aQ62066 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms