Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd47Q61735 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd47Q61735 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd47Q61735 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd47Q61735 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd47Q61735 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd47Q61735 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd47Q61735 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd47Q61735 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cd47Q61735 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cd47Q61735 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cd47Q61735 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cd47Q61735 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd47Q61735 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms