Protein–RNA interactions for Protein: Q61142

Spin1, Spindlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin1Q61142 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spin1Q61142 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spin1Q61142 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spin1Q61142 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Spin1Q61142 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spin1Q61142 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spin1Q61142 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spin1Q61142 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spin1Q61142 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spin1Q61142 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spin1Q61142 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spin1Q61142 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spin1Q61142 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spin1Q61142 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spin1Q61142 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spin1Q61142 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms